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《大日經疏》是一行的隨堂筆記，課本是《大日經》，講師是善無畏。《大日經》被翻成漢文時，一行便有參與；此《疏》據稱是善無畏為唐玄宗開講，一行在旁邊記下來的。玄宗可能時常曠課，所以要一行幫他作筆記。 

    經中在遇到真言時，會用漢字音譯保留梵文的原音；而在疏中，若遇到重要的偈文，經中沒有音譯，善無畏覺得若能用梵語讀更好，一行也會特別音譯保存。若經中大日如來所說的話有加持的作用，即便不是偈語，善無畏也會特別點出，要一行音譯保留梵音。譬如，大日如來回答住無戲論執金剛問三昧耶戒時所說的話，善無畏就說若傳授時要先誦持梵本，再以方言解釋。《大日經》的梵本已經不存，幸好智儼、溫古根據《大日經疏》編修的《大日經義釋》在一行音譯的旁邊保留了梵字悉曇，否則光是看漢字音譯，讀誦出來可能沒什麼加持作用，大日如來應該聽不懂。

    這段話大意是：三昧耶戒和淨尸羅不同，是所謂慧方便等所集成之戒。住是戒者，當以身、語、意，合而為一。所有戲論諸見之網，皆悉淨除。不作一切諸法，住無為戒。觀身實際不可得故，即是如來解脫。發誓守戒後，動止施為，凡有所作，皆為如來解脫，非為己身。捨了自身，便是捨了身、語、意。善無畏說，梵本論中尚有一偈解釋此義： 

若有解脫人，持此解脫法，供養解脫者，此福最為勝。 

    這裡的「梵本論」不知何指，可能是善無畏在印度所學《大日經》的論典。大日如來最後說道：「以受身、語、意戒，得名菩薩。所以者何？離彼身、語、意故，菩薩摩訶薩，應如是學。」《大日經疏》云：「此中應學，舊譯名為式叉迦羅尼，猶如第五篇戒，總攝毗尼犍度威儀行法。大乘學者亦如是，當持此戒，方便普入一切真言行中；苟戒有虧，而得成菩薩行，無有是處也。」式叉迦羅尼，即上一談所言惡作罪聚，此部份戒條，每事結句皆云應學，不似前四篇章，以罪名作結。且此篇皆是有關威儀之事；譬如，不應說話時口中仍有食物，不用舌頭舔缽，不手叉腰等等。此式叉迦羅尼，在最開始制戒時，沒編入根本戒本波羅提木叉，散見在犍度（各種規範，如受戒、食衣住行、布薩等）中，後來才編在一起，放在第五篇，所以說總攝毗尼犍度裡的威儀行法。